又到驪歌輕唱的季節，本校於6月12日在三連堂舉辦「99級畢業典禮」。今年特地將畢業典禮分為上午場與下午場來進行，上午場由工學院、數位設計學院、外籍生及進修部參加；下午場由商管學院、人文設計學院、進修部參加。畢業典禮當天由校長戴謙親自主持，戴謙校長以祝福的心情，祝福4328位應屆畢業生都有美好的人生規劃。現場除了許多家長到場觀禮外，立法院院長王金平、台南縣副縣長顏純左、台南市副市長洪正中、南科管理局局長陳俊偉、奇美醫學中心副院長王志中、台南縣工商策進會總幹事顏耀星、崑山科技大學校長蘇炎坤等貴賓均親臨到賀，給予畢業生祝福。該校電機碩士班外籍生普愛麗上台接受校長頒贈學位；該校資源教室聽障生王筱萍與許湘宜，在典禮上說出在南台科大四年受到師長們照顧的致謝詞。
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